Le mercredi 30 janvier 2013, Philippe FOLLIOT a été nommé secrétaire de la commission d’enquête sur le fonctionnement des services de renseignement français dans le suivi et la surveillance des mouvements radicaux armés. Suite à l’affaire Mohamed MERAH, l’Assemblée nationale s’est prononcée en faveur de la création d’une commission d’enquête lors d’une résolution adoptée le 5 décembre 2012. En effet, cette commission qui vise à reconnaître précisément « le fonctionnement des services de renseignement français dans le suivi et la surveillance des mouvements radicaux armés et, notamment, des filières jihadistes existant sur le territoire français », aura pour but d’émettre des observations sur les services de renseignement tels que la Direction centrale du Renseignement Intérieur (DCRI), la Direction Générale de la Sécurité Extérieure (DGSE) ou encore la cellule TRACFIN, sur les mouvements radicaux armés. Lors de la réunion constitutive, Philippe FOLLIOT a insisté sur le fait que cette commission n’aura pas vocation à s’intéresser à des affaires judiciarisées mais aura pour but de mettre en lumière le fonctionnement des services de renseignement français. Il assurera donc le secrétariat de cette commission tandis que la Présidence sera assurée par, Christophe CAVARD, député du Gard, et que le rapporteur sera Jean-Jacques URVOAS, député du Finistère mais également Président de la commission des lois.